FreeBSD는 자체 파일 시스템(file system)을 이용해서 많은 기초적인 시스템 연산(operations)을 결정하기때문에, 파일시스템의 계층구조 (hierarchy)는 엄청나게 중요합니다. hier(7) 사용 설명서 (man page) 에서 완벽하게 설명되에 있기 때문에, 생략하기로 합니다. 더 많은 정보를 원하면 hier(7) 을 읽어보십시오.
가장 중요한 것은 모든 디렉토리의 루트, 즉, / 디렉토리입니다. 이 디렉토리는 부팅할 때 맨 처음 마운트되고, 부팅에 필요한 기초 시스템 (base system)을 포함합니다. 루트 디렉토리는 또한 당신이 원하는 모든 다른 파일 시스템을 위한 미운트 지점 (mount point)를 포함합니다.
마운트 지점은 루트 파일 시스템에 접붙일 수 있는 추가적인 파일 시스템 입니다. 표준 마운트 지점은 /usr, /var, /mnt, 및 /cdrom을 포함합니다. 이들 디렉토리는 흔히 /etc/fstab 파일 내의 항목으로 참조됩니다. /etc/fstab은 시스템이 참조 할 다양한 파일 시스템과 마운트 지점의 목록입니다. /etc/fstab의 대부분의 파일 시스템이 부팅할 때 noauto 옵션이 포함하지 않는한 스크립트 rc(8)에 의해 자동으로 마운트 됩니다. /etc/fstab의 파일 포맷 및 옵션들 에관한 더 자세한 정보는 fstab(5) 를 보십시요.